平戸では「(株)長崎ファーム」がマグロ養殖を行っており、品質向上における日々の研究のほか、養殖場の底質改善など魚の健康に配慮した養殖が行われる。天然幼魚から養殖された平戸のマグロは、程よく脂がのり美味との評価を受けている。